湿地微生物实验室成立于2018年，隶属于黑龙江省寒区湿地生态与环境研究重点实验室。实验室依据国民经济和社会发展的重大需求为导向，聚焦湿地微生物领域前沿，针对寒区湿地环境面临的主要问题，应用微生物学的基础理论和技术体系，开展湿地环境微生物基础研究、应用基础研究和应用开发研究，为寒区湿地环境保护提供微生物资源、技术和工艺。
主要研究方向有:湿地环境微生物资源和生态适应、功能研究；湿地微生物驱动地球化学循环机制研究；湿地微生物适应机制与环境生物技术；寒地冻土微生物多样性与宏基因组学;湿地环境微生物资源收集与发掘；湿地有机污染物微生物降解与修复；湿地土壤重金属污染物微生物修复；微生物肥料与生物农药等。
